Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms