Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTA1P02549 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPTA1P02549 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPTA1P02549 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPTA1P02549 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTA1P02549 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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