Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIC3O95833 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms