Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SEMA3DO95025 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SEMA3DO95025 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3DO95025 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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