Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLSTN1O94985 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLSTN1O94985 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLSTN1O94985 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLSTN1O94985 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms