Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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