Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCAO15360 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCAO15360 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCAO15360 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms