Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNPHO15079 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNPHO15079 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNPHO15079 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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