Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP290O15078 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP290O15078 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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CEP290O15078 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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