Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RGPD3A6NKT7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms