Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms