Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms