Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms