Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms