Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A8Q9Y2E8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms