Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms