Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB23Q9ULC3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB23Q9ULC3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms