Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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