Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPC1L1Q9UHC9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms