Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms