Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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