Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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