Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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MIS18AQ9NYP9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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