Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSD3Q9NYI0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms