Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN6Q9NWW5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms