Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms