Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDP1Q9NUW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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