Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C11orf49Q9H6J7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms