Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDGFDQ9GZP0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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