Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CELF4Q9BZC1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms