Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms