Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms