Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERPUD2Q9BSE4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms