Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms