Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCF12Q99081 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCF12Q99081 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms