Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms