Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SAMD8Q96LT4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD8Q96LT4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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