Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms