Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNDC1Q96C34 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms