Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG2BQ96BY7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms