Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL2Q969S2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms