Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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RABGGTAQ92696 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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