Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENOMQ8WWX9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms