Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGR3Q8TD06 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms