Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NEDD1Q8NHV4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NEDD1Q8NHV4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NEDD1Q8NHV4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms