Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC38A9Q8NBW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC38A9Q8NBW4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms