Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SV2AQ7L0J3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms