Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECW1Q76N89 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms