Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms