Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q6P435 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6P435 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6P435 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6P435 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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